Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms