Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms