Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bod1Q5SQY2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bod1Q5SQY2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms