Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SynaQ5G5D5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms