Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms