Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms