Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp22Q5DU02 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp22Q5DU02 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp22Q5DU02 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms