Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms