Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chsy3Q5DTK1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms