Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms