Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc84Q4VA36 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms