Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms