Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5935Q497S0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5935Q497S0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms