Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms