Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3UZV7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UZV7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms