Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn13Q3UW68 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms