Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chpf2Q3UU43 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms