Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd4Q3UTY6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms