Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef9Q3UTH8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms