Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6899Q3USS0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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