Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fchsd2Q3USJ8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fchsd2Q3USJ8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fchsd2Q3USJ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fchsd2Q3USJ8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fchsd2Q3USJ8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fchsd2Q3USJ8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fchsd2Q3USJ8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fchsd2Q3USJ8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fchsd2Q3USJ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fchsd2Q3USJ8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fchsd2Q3USJ8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fchsd2Q3USJ8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms