Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms