Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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