Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Elf3Q3UPW2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Elf3Q3UPW2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms