Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa3Q3UPR0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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