Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arhgef40Q3UPH7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Arhgef40Q3UPH7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arhgef40Q3UPH7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arhgef40Q3UPH7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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