Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms