Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cobll1Q3UMF0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms