Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms