Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms