Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf5Q3UK78 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms