Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Usp19Q3UJD6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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