Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Edc4Q3UJB9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edc4Q3UJB9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms