Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms