Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms