Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mier3Q3UHF3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mier3Q3UHF3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms