Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms