Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms