Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms