Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms