Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA16

Spc25, Kinetochore protein Spc25, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc25Q3UA16 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Spc25Q3UA16 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc25Q3UA16 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc25Q3UA16 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc25Q3UA16 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc25Q3UA16 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc25Q3UA16 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc25Q3UA16 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc25Q3UA16 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc25Q3UA16 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms