Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cops9Q3U898 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cops9Q3U898 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cops9Q3U898 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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