Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U7U4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms