Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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