Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorlQ3U285 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms