Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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