Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc28Q3TX51 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms