Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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