Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc136Q3TVA9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms