Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTL0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTL0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms